2016年4月，海关总署复函湖北省政府，批准湖北省在武汉市建设多式联运海关监管中心，规划按照“一心两区、港站衔接”的模式建设，即在武汉水运口岸（阳逻港）和武汉铁路口岸（中心站，汉欧班列始发地）分别设立监管区。

水运口岸位于阳逻集装箱码头一期、三期堆场后方，重点建设海关特殊监管区、检验检疫处理区、办公、停车以及配套服务区。

武汉多式联运海关监管中心（阳逻）项目，建设用地215亩，建设内容为新建检验检疫查验区、检验检疫处理区、海关监管查验区、停车场、业务办公及配套服务区。总投资估算6.9亿元。2017年12月28日开工，计划2018年完成主体工程，2019年投入使用。